MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 1386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	CTGG	2	8	109	116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014017	GTTC	2	8	148	155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014017	CTG	2	6	198	203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014017	CT	3	6	231	236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014017	ACA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014017	GCT	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496809
7	NC_014017	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
8	NC_014017	GAC	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
9	NC_014017	CGA	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496809
10	NC_014017	CG	3	6	699	704	0 %	0 %	50 %	50 %	294496809
11	NC_014017	GTCA	2	8	840	847	25 %	25 %	25 %	25 %	294496809
12	NC_014017	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496809
13	NC_014017	GCG	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496809
14	NC_014017	TAA	2	6	1029	1034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014017	CAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014017	GTG	3	9	1069	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496810
17	NC_014017	TGA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496810
18	NC_014017	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
19	NC_014017	TTA	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496810
20	NC_014017	C	6	6	1193	1198	0 %	0 %	0 %	100 %	294496810
21	NC_014017	AT	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
22	NC_014017	AT	3	6	1243	1248	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
23	NC_014017	TAAG	2	8	1255	1262	50 %	25 %	25 %	0 %	294496810
24	NC_014017	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496810
25	NC_014017	GTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496810
26	NC_014017	AAT	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496810
27	NC_014017	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014017	TTTTG	2	10	1532	1541	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014017	AAC	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014017	CAG	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014017	T	6	6	1570	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014017	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014017	ATC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014017	ATTT	2	8	1655	1662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014017	AGC	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014017	AGCC	2	8	1805	1812	25 %	0 %	25 %	50 %	294496811
37	NC_014017	ATC	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496811
38	NC_014017	GGT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
39	NC_014017	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
40	NC_014017	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496811
41	NC_014017	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496811
42	NC_014017	TGG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
43	NC_014017	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496811
44	NC_014017	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496811
45	NC_014017	GCAG	2	8	2237	2244	25 %	0 %	50 %	25 %	294496811
46	NC_014017	T	6	6	2388	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014017	TC	3	6	2424	2429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014017	TAC	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014017	ATCTAT	2	12	2467	2478	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014017	GCA	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014017	TA	3	6	2524	2529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014017	TA	3	6	2531	2536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014017	TCA	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014017	GCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014017	A	6	6	2761	2766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014017	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014017	AGCC	2	8	3031	3038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014017	AT	3	6	3051	3056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014017	TGC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014017	CGC	2	6	3098	3103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014017	CAG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014017	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014017	GT	3	6	3282	3287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014017	TCA	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014017	AC	3	6	3368	3373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014017	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014017	T	6	6	3415	3420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014017	A	9	9	3449	3457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014017	GGAT	2	8	3545	3552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014017	CAT	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014017	AGAT	2	8	3607	3614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014017	TGA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014017	CCG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014017	GTT	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014017	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014017	A	7	7	3803	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	294496812
77	NC_014017	AAG	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014017	TCT	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014017	TAAA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014017	TTC	2	6	4273	4278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
81	NC_014017	AGAA	2	8	4317	4324	75 %	0 %	25 %	0 %	294496813
82	NC_014017	T	7	7	4368	4374	0 %	100 %	0 %	0 %	294496813
83	NC_014017	TC	3	6	4396	4401	0 %	50 %	0 %	50 %	294496813
84	NC_014017	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496813
85	NC_014017	GTA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496813
86	NC_014017	ATT	2	6	4498	4503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496813
87	NC_014017	CAGCC	2	10	4585	4594	20 %	0 %	20 %	60 %	294496813
88	NC_014017	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
89	NC_014017	GA	4	8	4623	4630	50 %	0 %	50 %	0 %	294496813
90	NC_014017	TCG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
91	NC_014017	TCA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
92	NC_014017	ACCA	2	8	4777	4784	50 %	0 %	0 %	50 %	294496813
93	NC_014017	CTG	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
94	NC_014017	ACG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496813
95	NC_014017	TAA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496813
96	NC_014017	TGC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496813
97	NC_014017	TTCC	2	8	5030	5037	0 %	50 %	0 %	50 %	294496813
98	NC_014017	AAGC	2	8	5085	5092	50 %	0 %	25 %	25 %	294496813
99	NC_014017	CCG	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496813
100	NC_014017	CAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
101	NC_014017	AATT	2	8	5157	5164	50 %	50 %	0 %	0 %	294496813
102	NC_014017	TCA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496813
103	NC_014017	AGC	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
104	NC_014017	GTCA	2	8	5358	5365	25 %	25 %	25 %	25 %	294496814
105	NC_014017	AAC	2	6	5370	5375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
106	NC_014017	TCCA	2	8	5419	5426	25 %	25 %	0 %	50 %	294496814
107	NC_014017	GACT	2	8	5431	5438	25 %	25 %	25 %	25 %	294496814
108	NC_014017	CCG	2	6	5567	5572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496814
109	NC_014017	CAG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
110	NC_014017	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
111	NC_014017	GACT	2	8	5673	5680	25 %	25 %	25 %	25 %	294496814
112	NC_014017	AGC	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
113	NC_014017	TAA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
114	NC_014017	AAG	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496814
115	NC_014017	AGC	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
116	NC_014017	ATC	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496814
117	NC_014017	ATA	2	6	5850	5855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496814
118	NC_014017	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
119	NC_014017	TCT	2	6	5869	5874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496814
120	NC_014017	ATCA	2	8	5940	5947	50 %	25 %	0 %	25 %	294496814
121	NC_014017	CCAT	2	8	5972	5979	25 %	25 %	0 %	50 %	294496814
122	NC_014017	GATGTC	2	12	5995	6006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294496814
123	NC_014017	CAC	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496814
124	NC_014017	AAC	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496814
125	NC_014017	TTTGG	2	10	6061	6070	0 %	60 %	40 %	0 %	294496814
126	NC_014017	TGGA	2	8	6112	6119	25 %	25 %	50 %	0 %	294496814
127	NC_014017	CAG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
128	NC_014017	AGC	2	6	6267	6272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496814
129	NC_014017	TAT	2	6	6369	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014017	A	6	6	6409	6414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014017	AAC	2	6	6422	6427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014017	AT	3	6	6443	6448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014017	CGC	2	6	6467	6472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014017	GAC	2	6	6549	6554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014017	CTG	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014017	CTTT	2	8	6604	6611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014017	TCG	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014017	CAG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014017	AT	3	6	6641	6646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014017	A	6	6	6701	6706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014017	TCAG	2	8	6716	6723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014017	CAC	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_014017	CGC	2	6	6931	6936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014017	CAT	2	6	6958	6963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014017	GGACC	2	10	7060	7069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_014017	TTA	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014017	TGTAG	2	10	7103	7112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014017	CCA	2	6	7180	7185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_014017	G	7	7	7196	7202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014017	TGT	2	6	7203	7208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014017	ATG	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014017	AGC	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014017	TCC	2	6	7368	7373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_014017	CCCT	2	8	7408	7415	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
155	NC_014017	CAG	2	6	7429	7434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_014017	AT	3	6	7595	7600	50 %	50 %	0 %	0 %	294496815
159	NC_014017	CA	3	6	7607	7612	50 %	0 %	0 %	50 %	294496815
160	NC_014017	GCCA	2	8	7745	7752	25 %	0 %	25 %	50 %	294496815
161	NC_014017	CAC	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496815
162	NC_014017	CAG	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496815
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165	NC_014017	GGC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496815
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170	NC_014017	ATTAA	2	10	8295	8304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014017	CCGG	2	8	8421	8428	0 %	0 %	50 %	50 %	294496817
172	NC_014017	CTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496817
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175	NC_014017	TG	3	6	8504	8509	0 %	50 %	50 %	0 %	294496817
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183	NC_014017	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	294496817
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185	NC_014017	CAC	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_014017	ATC	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_014017	ATC	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_014017	ATT	2	6	12744	12749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496822
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281	NC_014017	A	6	6	13176	13181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014017	A	6	6	13243	13248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_014017	TTAT	2	8	13446	13453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_014017	AAGC	2	8	19177	19184	50 %	0 %	25 %	25 %	294496826
413	NC_014017	GCCGC	2	10	19233	19242	0 %	0 %	40 %	60 %	294496826
414	NC_014017	AAT	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496826
415	NC_014017	CTT	2	6	19270	19275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496826
416	NC_014017	TGT	2	6	19278	19283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496826
417	NC_014017	TGGC	2	8	19296	19303	0 %	25 %	50 %	25 %	294496826
418	NC_014017	GTG	2	6	19315	19320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
419	NC_014017	TTG	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_014017	TGG	2	6	20288	20293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496828
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443	NC_014017	CGG	2	6	20573	20578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496828
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450	NC_014017	TGT	2	6	20926	20931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496828
451	NC_014017	AAT	2	6	20962	20967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014017	CAT	2	6	20977	20982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_014017	CGG	2	6	21087	21092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_014017	CA	3	6	21144	21149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
456	NC_014017	AAT	2	6	21158	21163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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